¿Alguien podría decirme el nombre de algún libro o manual que tenga todas las formas de conjugar un verbo en japonés?

No creo que haya tal manual considerando que ''todo'' incluiría dialectos y formas arcaicas y obsoletas. Sí, el japonés tiene muchos auxiliares y conjugaciones, como 令む「しむ」 el cual es la forma arcaica de formar el causativo, 食べさせる > 食べしむ.

Si quieres una tabla útil de formas verbales y equivalentes de partículas en varios dialectos japoneses esta lista es muy útil: http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%97%A5%E6%9C%AC%E8...

Luego tienes estas dos páginas sobre gramática arcaica:

http://www.hello-school.net/haroajapa000top.htm

http://homepage3.nifty.com/bunpou/

Para el resto sólo te queda usar diccionarios, pero usa diccionarios monolingües, olvídate de diccionarios bilingües. Los diccionarios japoneses suelen contener todo tipo de explicaciones sobre cada terminación y auxiliar, cosa que no conseguirás ni en el Jim Breen. Sé que es tedioso no tener una lista en concreto y tener que ir aprendiendo sobre esas terminaciones a medida que leas pero generalmente no hay de otra.

Estas tres páginas te serían útiles para gramática en general:

http://www.jgram.org/pages/viewList.php?lv=4

http://www.tanos.co.uk/jlpt/jlpt1/

https://www.renshuu.org/learn/grammar_library# (lamentablemente cambiaron la interfaz y el diseño completamente, ahora hay que registrarse para acceder propiamente a toda la librería de gramática pero es gratis y rápido, así que vale la pena)

Tu pregunta me suena a que andas lidiando con formas no comunes, porque las comunes las encuentras en cualquier lado. Sería mejor que vayas aprendiendo sistemáticamente las conjugaciones mediante el uso y la lectura.